先进动力与热工技术研究所（原名多相流体动力学研究所）由原飞行器动力工程教研室和建筑环境与能源应用教研室合并组建，目前有专职教师22人，兼职教师3人（其中兼职院士1人，兼职教授2人），教授5人，副教授8人，讲师8人，18人拥有博士学位，力学一级学科博导7人，硕士导师13人，具有航空宇航科学与技术、动力工程及工程热物理、土木工程一级学科硕士授予权。研究所有“飞行器动力工程”和“建筑环境与能源应用工程”2个本科专业，拥有部级创新团队和哈尔滨工程大学“多项流体动力学”兴海团队。研究领域包括航空宇航推进、水下动力推进、超空泡航行体技术、火灾动力学与消防安全工程、暖通与舱室环境、多相流体动力学等。研究所拥有“飞行器动力工程”和“建筑环境与能源应用工程”专业实验室，以及金属燃料发动机科研实验室，依托学院与航天科工六院合作成立了“跨介质动力学”联合实验室，与汉光集团成立了“金属燃料新型动力”联合实验室，与香港理工大学合作成立了“火灾与消防技术”联合实验室，与航天科工集团31所合作成立了“航空发动机滑油系统实验室。多年来研究所在相关领域的研究取得了较大的成绩，形成了一定的技术优势与行业影响力，具有较大的发展潜力。